L’interno della Chiesa è a croce latina, con l’apertura sulle navate laterali di piccole cappelle con reliquiari, una di queste, al lato dell’altare custodisce le tombe di Giacomo e Vincenzo Arcucci. Giacomo fu il fondatore della Certosa di San Giacomo infatti la tomba riproduce l’aristocratico Giacomo con in mano il progetto della Certosa.