Allontanandoci dalla Piazzetta e percorrendo la strada che giunge a Villa Jovis si ammira una piccola chiesa, protetta da un muro di cinta e dalla flora del giardino, chiamata Chiesa di San Michele. Essa prende il nome dalla vicinanza ad una grotta, sempre dedita al culto di San Michele Arcangelo, un tempo usata come rifugio durante le incursioni saracene.